La gestió del CER està encomanda a la Societat Anònima Municipal, de nova creació, Flix Gestió d'Iniciatives Econòmiques, GIE. Una societat mercantil de capital integrament públic, que s'encarrega de garantir els serveis bàsics als usuaris del centre i també de cercar serveis externs per activitats puntuals d'animació empresarial o de suport a emprenedors.