San Pellegrino in Vaticano ou Igreja de São Peregrino no Vaticano é um antigo oratório na Via dei Pellegrini, no Vaticano, e dedicada a São Peregrino de Auxerre, um padre romano nomeado pelo papa Sisto II e martirizado na Gália no. É uma das igrejas mais antigas do Vaticano.A igreja foi construída pelo papa Leão III por volta de 800 e recebeu o nome de "San Pellegrino in Naumachia", uma referência à naumaquia construída a noroeste do Castel Sant'Angelo e dedicada pelo imperador romano Trajano em 109. No, o papa Clemente X cedeu a igreja para a Pontifícia Guarda Suíça, que a utilizou para seus serviços religiosos, juntamente com Santi Martino e Sebastiano degli Svizzeri, até 1977. Depois da cessão, a igreja caiu em desuso e começou a se arruinar, mas foi restaurada no quando evidências de afrescos do foram descobertos. Com o nome de San Pellegrino degli Svizzeri, foi transformada na igreja nacional da Suíça.